La estructura de la Fundación está basada en Programas, cada uno en su ámbito, mediante los que se desarrollan los diferentes proyectos; y cuenta con los siguientes órganos para su dirección y gobierno:
El Patronato
Órgano supremo de gobierno, administración y representación. Sus funciones fundamentales son el establecimiento de las líneas generales de actuación y la aprobación de los planes, los programas, los presupuestos y las cuentas de la FGUCLM.
Presidente
D. JOSÉ JULIÁN GARDE LÓPEZ-BREA
Secretaria
Dª. ISABEL GALLEGO CÓRCOLES
Vocales
D. FELIX SANZ ROLDAN
Dª. ÁNGELES CARRASCO GUTIÉRREZ
Dª. ÁNGELA GONZÁLEZ MORENO
D. SANTIAGO GUTIÉRREZ BRONCANO
D. RAÚL MARTÍN MARTÍN
D. FRANCISCO JOSÉ SÁEZ MARTÍNEZ
D. CÉSAR SÁNCHEZ MELÉNDEZ
Dª. MATILDE YEBRA GAGO
D. JESÚS BÁRCENAS LOPEZ
Dª. SONIA COLOMER ROCHER
D. JUAN RAMÓN DE PÁRAMO ARGÜELLES
D. MARIANO LEÓN EGIDO
D. JESÚS ESTEBAN ORTEGA
Dª. LUIS GARCÍA MONTERO
El Consejo Ejecutivo
Órgano colegiado que ejerce por delegación del Patronato las facultades de gestión ordinaria, a excepción de las indelegables legalmente.
Presidente
D. JUAN RAMÓN DE PÁRAMO ARGÜELLES
Vice Presidente
D. FRANCISCO JOSÉ SÁEZ MARTÍNEZ
Secretario
D. ELISEO CUADRAO DE LA GUÍA
Vocales
Dª. MATILDE YEBRA GAGO
Dª. ANGELA GONZÁLEZ MORENO